专业定位：围绕福建省经济特色，按照生物工程培养计划“具有创新精神和实践能力的高素质应用型人才”的人才培养定位，坚持发酵、生物农药及食药用菌专业培养方向相结合，立足福建，面向全国，为行业发展提供智力支撑。

培养目标：培养具有生物工程基本知识，掌握生物工程技术原理、工艺技术过程和工程设计的基本理论和基本技能，能在生物技术与工程领域从事设计、生产、管理以及新技术和新产品开发的应用型、复合型、创新型生物工程技术人才。

主干课程：发酵工程、化工原理、生物分离工程、生物工程设备、基因工程及生物制药等。

就业方向：本专业具有强大的师资力量，其中70%的专任教师具有博士学位，具有出国留学经历的专任教师占55%。毕业生可在机关事业单位、酿造与食品企业等从事管理与技术研发工作，也可以在高校或科研机构从事教学、科研或管理工作。