目前设置生物工程专业的高等学校几乎遍及全国,保守估计在150所左右,在四川,包括我校, 四川大学, 西南民院, 西南科大等在内的数所大学设立了生物工程专业.生物工程专业在全国总体上均属于起步阶段, 我校生物工程在学科发展上仍具备很大的发展空间. 结合我校的工科教学背景,化学基础和西部生物资源优势,我系的生物工程学科确定了以生物化学与分子生物学为基础, 以生物制药和生物信息学为核心,全面带动基因工程, 发酵工程及生化工程发展的学科发展方向. 在研究领域上, 结合我们在特殊领域的人才优势和在西部, 尤其四川潜在的发展空间, 我们确定生物工程的主要研究领域是基于西部中药资源 (包括蕈菌) 的基础研究,药物研发.技术支撑平台主要包括 (1)生物信息学技术; (2)生物芯片技术; (3)生物文库与分子进化技术; (4)生物化学与分子生物学技术;(5)基因工程与发酵工程技术;(6)天然产物化学与化工技术;(7药用植物资源.同时开展针对基因组计划的人类基因组, 植物和微生物基因组等的基础和应用研究. 该方向在国内外均有巨大发展空间.