培养目标：制药工程专业依托植物保护一级学科博（硕）士学位点、博士后科研流动站、农药学二级学科博（硕）士学位点、生物农药与化学生物学教育部重点实验室等学科平台，已获得台湾中华工程教育学会（IEET）工程及教育科技认证，同时顺利完成了中国工程教育认证专家组现场考察工作。学院正以中国工程教育认证标准办学，致力培养适应社会发展和经济建设需要，具备良好人文素养与职业道德、沟通能力与协作精神、突出的创新潜质和国际化视野，注重终身学习、专业发展和领导能力的培养，在制药及相关领域的生产与质量管理、工艺与工程设计、技术与产品研发及经营管理等企业核心工作岗位具备较强竞争力的工程技术和管理骨干人才。

主要课程：普通化学、有机化学、分析化学、物理化学、生物化学、工程制图、化工原理、药物化学、工业药剂学、制药工艺学、制药设备与工艺设计、药物分析、制药分离工程等。

就业方向：毕业生适宜在制药及相关领域的质检、环保、精细化工和生物药业、医药流通企业等政府相关管理部门和企事业单位就业，从事生产与质量管理、工艺与工程设计、技术与产品研发及经营管理等岗位工作。

培养效果：本专业培养的学生就业率达98%, 其中部分学生考取硕士研究生继续深造，成为药物研究与开发的高级专业人才。本专业毕业生在医药、农药、精细化工和生物制品行业的产品研发、生产管理、药物经营、药事管理等部门就业，用人单位认为“制药工程的毕业生能适应药物产品生产、研究与开发、药物经营与管理等方面的工作，较快成长为业务骨干”。