本专业依托植物保护一级学科博士点、博士后科研流动站和菌物学二级学科博士点，植物病理学、森林保护、菌物学三个硕士点，培养具备坚实的菌物资源学、食药用菌育种学、食药用菌栽培学、食药用菌工厂化栽培、珍稀食药用人工驯化学、菌类食品工艺学、菌物产品安全学、菌糠营养开发与循环利用、毒菇学方面的基本理论和实践技能，掌握现代生物科学技术，具有创新意识的复合型高级专业人才。毕业生能在教育、农业、林业、工业等菌物领域的各级院校、科研单位、企事业单位从事菌物（菌物食品、菌物饲料、菌物肥料、生物农药等）教学、科研、生产、技术推广开发、经营和管理等工作。合格毕业生授予农学学士学位。

主要课程：微生物学、植物生理学、植物病理学、菌物资源学、遗传学、发酵工程、食用菌育种学、食用菌栽培学、菌糠营养开发与循环利用等专业课程。