信息安全学科是信息与通信工程一级学科下的二级学科，成立于2003年。现已设立信息安全硕士、博士点。该学科设有东南大学信息安全研究中心，2005年该中心与计算机科学与工程学院联合申请成立了江苏省网络与信息安全重点实验室。近年来，在国家“985”、“211”及“江苏省优势学科”建设工程的重点支持下，实验环境不断得到改善和提高，建立了一整套移动通信网实验和测试平台，为本学科的发展提供了有力的支持。目前，在无线网络和移动通信安全领域，本学科处于国内领先水平。

目前，学科主任由胡爱群教授担任。现有教授2人，副教授8人，讲师6人，其中具有博士学位的占91%，有海外学习经历的占33%，45岁以下的占83%。目前在校博士生7人，硕士生人数80多人。

信息安全学科致力于移动通信和无线网络安全的理论和技术的研究，涉及通信安全、内容安全、可信计算、接入安全、终端安全、信息监管等多个研究方向。

近年来，学科先后承担一系列国家 “863”计划、国家自然科学基金项目、国家重大专项与重点研究项目、各大部委项目，以及国际、国内政府与企业的合作项目共计20多个，科研经费近2000万元。近五年获得国家及部省科技奖励数3项，发表各类论文达200多篇，其中被SCI、EI收录论文达160多篇，取得国家技术发明专利 32项。在无线网络和移动通信安全领域先后研制了“公共无线局域网安全接入系统”、“移动通信网络监管系统”、“无线局域网设备安全评估系统”、“高精度无线定位系统”、“网络应急通信设备”、“无线传感器网络安全测试床”、“移动终端保密通信装置”、“3G无线安全视频监控系统”等一系列实用化成果。

学科着力于提高人才培养质量，创新人才培养方式，形成了有特色的从本科生、硕士生、博士生到博士后的教学和培养体系。研究生规划教材《网络与信息安全基础理论与应用》和本科生精品教材《信息安全》，为国内多所高校使用。国内外学术交流广泛，定期聘请知名专家来校讲学。多位本科学生毕业设计论文获得江苏省优秀本科生毕业设计论文，3篇硕士研究生论文获江苏省优秀硕士学位论文。指导学生获全国大学生电子设计竞赛信息安全技术专题邀请赛一等奖6项、二等奖5项，获IEEE Xtreme programming competition 4.0国际大奖4项。

学科为国内相关安全管理部门提供优质的技术服务的同时，针对无线网络和移动通信领域的安全市场，积极和国内通信和安全厂商展开广泛的合作与交流，先后与华为、中兴、十四所、国人通信、擎天科技、北京天融信、维尔科技、天鹅科技等国内多个企业建立了密切合作关系，多项实用化成果实现了产业化，取得了很好的社会效益和经济效益。