内蒙古医科大学中医学院是自治区唯一一所能够培养中医学本科、研究生的高等教育结构， 1958年创建中医学本科专业，1986年伤寒学获批硕士学位授予学科，2003年中医内科、方剂学获得硕士学位授予权，2011年中医学成为硕士学位授予一级学科，并于2005年开始与北京中医药大学联合培养中医学博士生，积累了丰富的高层次人才培养经验。目前形成了中医学科门类齐全，中医学本科、研究生培养层次齐备的学科专业体系，中医、西医等多学科、多领域、多层次相互交叉渗透的学科特点。

中医学2007年成为内蒙古自治区品牌专业，2012年伤寒学成为国家中医药管理局重点建设学科。2013年“中蒙医临床模拟中心”被教育部评为“国家级实验教学示范中心”。

中医学师资队伍中有教授22人、副教授15人，讲师9人，助教18人；北京中医药大学兼职博导2人，硕士生导师30人；具有博士学位者4人，硕士学位者32人，在读博士4人；国家级名老中医1人，自治区级名老中医2人，自治区有突出贡献的中青年专家1人，享受政府特殊津贴专家4人，自治区“新世纪321人才工程”第二层次人选2人；拥有自治区级、校级教学名师、教坛新秀各1人，自治区级品牌专业2个，自治区级精品课程5门，校级精品课程11门，中医内科学为校级优秀教学团队。主持完成国家自然科学基金、国家中医药管理局等课题10余项，省部级课题60多项，科研经费已达到400多万元；获得自治区科技奖励5项。

在校全日制本科生1400余名，硕士研究生50余名，近10年来，我院学生多次在国内中医药基础及临床技能等比赛中获得优异成绩，应届毕业生考研录取率均在30%以上，居全校第一；毕业生首次就业率近90%，在同类院校中名列前茅，为国内外及自治区培养中医药高级专业人才4000余名，许多校友成为国内知名中医药界的专家及杰出人才，多数成为自治区各级医疗、科研、教学、管理岗位的学术带头人和业务骨干，是内蒙古培养中医药高级人才的重要教学基地。